Members

Interdisciplinary and international teams currently compose the ImmunoComplexiT  network

Integrative Immunology

CNRS FRE3632, UPMC INSERM UMRS959 Immunology, Immunopathology, Immunotherapy- Paris, France

  • Thomas-Vaslin Véronique, Integrative immunology, High-Throughput data analysis, T-cell population dynamics and repertoire modeling- Perturbations & Aging
  • Six Adrien, Integrative immunology – Lymphocyte repertoire diversity & perturbations- high-throughput & multiscale analysis- biological signatures
  • Klatzmann David  Immunologist, systems immunology approaches for immunopathologies  and immunotherapies.
  • Hang-Phuong Pham,   Statistical modelling of multiparameter and multiscale immunological data, cell population and repertoire diversity, perturbations, variability.
  • Chaara Wahiba Repertoire diversity analysis
  • Dérian Nicolas Transcriptome analysis- Unsupervised analysis, signatures
  • Abi-Haidar Alaa,  Modeling T cell population and dynamics complexity- Multiagent modeling-Data mining, artificial immune systems-Visualization of data
  • Maria Grazia Ruocco, imaging, tolerance, immune cells
  • Encarnita Mariotti-Ferrandiz: systems immunology; standardisation ; autoimmunity ; high-throughput sequencing ; immune diversity ; statistical modeling
  • Ioanis Drakos, Biomedical data management: data base; LIMS; data integration; data safety; data security
  • Pierre-André Cazenave, Immunologist, Integrative Immunology, Immunoparasitology
  • Nehar Belaid Djamel, systems immunology, cancer, Tregs, maternofetal tolerance, tolerance
  • Michel Morvan, Doctorant- Modélisation multi-agent du système immunitaire -Modèles informatiques multi-agent, UML, Classes-Relations,  Logique de Thomas, Multi-échelle, systèmes complexes

Microsoft Research, Cambridge

  • McEwan Chris, Computer science, modeling T cell dynamics with visual languages and statecharts, artificial immune systems

ACASA- LIP6 UPMC

  • Jean-Gabriel Ganasci, artificial intelligence, computer science, data mining
  • Abi-Haidar Alaa, computer science data & text mining

Université Libre de Bruxelles,  IRIDIA/CODE

  • Bersini Hugues, Université Libre de Bruxelles,  IRIDIA/CODE- Engineering, computer science & modelling, oriented object computing, artificial immune systems, Immune networks and learning

INSERM U897 Epidemiology & Biostatistics, ISPED Institut de Santé Publique d’Epidémiologie et de Développement, Unité de Soutien Méthodologique à la Recherche Clinique, CHU Bordeaux, Université Victor Segalen Bordeaux 2, France.

Laboratory on Thymus Research, Oswaldo Cruz Institute, Oswaldo Cruz Foundation, Rio de Janeiro, Brazil.

  • Savino, Wilson,  Immunologist, thymus exploration from 3-D architecture to genome, modeling thymocytes differentiation in physiological and pathological conditions.

South African National Bioinformatics Institute, University of Western Cap, Captown, SouthAfrica.

  • Gamieldien Junaid, Knowledges management, graphical formalism, large-scale semantic integration of biomedical information.

Institut Camille Jordan UMR CNRS 5508, Université Lyon 1, Equipe Inria Dracula, Centre Inria Grenoble Rhône Alpes

CGPMC CNRS  Lyon Bases Moléculaires de l’Auto-Renouvellement et ses Altérations

  • Olivier Gandrillon

Neurobiologie et developpement CNRS GIF

  • BOURGINE Paul, Systèmes complexes – grands réseaux interactifs – systèmes dynamiques – théorie de la viabilité- reconstruction des dynamiques multi-échelles comme modèle intégré

UR 341 Mathématiques et Informatique apppliquées INRA

  • Natacha Go, Modélisation de la réponse immunitaire (centrée sur l’interaction macrophage-pathogène). Modèles mathématiques déterministes dynamiques à compartiments.  Analyse de sensibilité. Analyse des états d’équilibre.

UFR Philosophie, Université Paris 4 Paris-Sorbonne

  • Thomas PRADEU, Philosophie des sciences et immunologie théorique

CoMPLEX, Physics building, University College London

  • Noiret Lorette, interorgan model, statistics, mathematical modeling, biomathematics, ammoniac metabolism, liver cirrhosis, hepatic encephalopathy,  kidney.

Center for Complex Networks and Systems Research, School of Informatics and Computing. Indiana University. USA

The CoSMo company, Lyon-France http://www.thecosmocompany.com/

  •  La Rota Camilo Modélisation de systèmes complexes biologiques; simulation, systèmes complexes, biologie, dynamique multi-échelle

Groupe International d’Etudes Transdisciplinaires (GIET) giet-info.org

  • Jacquemart Frédéric, Evaluation globale de la perturbation des systèmes complexes; complexité, écologie.

INRA  Molecular Immunology and Virology (VIM)

  • Pierre Boudinot, répertoires B et T,  réponses antivirales  et analyses de transcriptomes, chez les poissons, dans une perspective d’immunologie comparée
  • Susana MAGADAN, B and T cell repertoire analysis. Evolution of the immunoglobulin loci and the mechanisms of immunoglobulin diversity generation in vertebrates.

Laboratoire de Physique Théorique- Ecole Normale Supérieure,  UMR 8549 CNRS, CGE

  • Aleksandra Walczak, Biophysique théorique- Quantitative immunology, statistical methods, biophysical models

Laboratoire de Physique Statistique CNRS & CGE (Ecole normale supérieure) UMR8550 (LPS-ENS) http://www.lps.ens.fr/

  • Thierry Mora.  Immunologie quantitative; méthodes statistiques; biophysique. Etude des répertoires de récepteurs de lymphocytes; biophysique

Faculté des Sciences de Tunis, Université de Tunis El Manar, campus Universitaire- Laboratoire de génétique, Immunologie et pathologies humaines

  • Amel Benammar Elgaaïed; Modélisation du risque de maladies multifactorielles et modélisation du fonctionnement du système immunitaire-marqueurs génétiques,  épigénétiques, facteurs environnementaux, Intéractions protéiques, data Mining, Docking, biologie des systèmes et immunologie integrative, diversité du répertoire
  • Walid Bedhiafi– Thèse PDIMSC-cotutelle avec Equipe Immunologie Integrative (Paris): Modélisation de la complexité multi-échelle des populations lymphocytaires-Immunologie intégrative; Différentiation des lymphocytes T & dynamique cellulaire; population cellulaire & et diversité des répertoires; Système multi-échelle.

Inria Sophia Antipolis http://team.inria.fr/abs

  • Frédéric Cazals– Modeling protein complexes (atomic models and coarse-grain models); Modeling the flexibility of proteins; Computational geometry and topology. Antibody – antigen complexes, protein assemblies, Voronoi diagrams, van der Waals models, geometric algorithms, combinatorial algorithms.

Centre d’Infection et d’Immunité de Lille- CNRS 8204-Inserm 1019, Institut Pasteur de Lille www.ciil.fr

  • Sylviane Pied– Immunoparasitologie; immunologie intégrative, malaria, pathologie, modèle mathématique

Drexel University School of Biomedical Engineering- simlab.biomed.drexel.edu

  • Uri Hershberg-Multi Scale nature of biology and cognition and System Immunology

Institut Pasteur, Unité de Biologie des Populations Lymphocytaires

  • François Huetz-Immunologie, Mémoire immunitaire Homme/souris, repertoire des cellules B-Long Lived Memory B cells

Université de Strasbourg  CNRS- Laboratoire Icube,  Equipe Bioinformatique théorique, Fouille de données et Optimisation stochastique

  • Pierre Collet, Professeur Unistra, evolutionary  algorithms, optimisation- complex systems
  • Pierre Parrend , Enseignant-Chercheur ECAM Strasbourg-Europe- Ecosystèmes immunitaires artificiels pour la sécurité et la supervision des systèmes d’information-sécurité; écosystèmes immunitaires artificiels; optimisation stochastique
  • Guigou Fabio, Doctorant:  supervision; sécurité; écosystèmes immunitaires artificiels
  • Navarro Lara Julio, Doctorant; computer security, artificial  immune systems-security, advanced persistent threats, SIEM
  • Jeannin-Girardon Anne; Maitre de Conférence en Informatique; big data, data mining, deep learning, biological system modeling, immune system, tissue development; http://icube-cstb.unistra.fr/fr/index.php/Anne_Jeannin

UPMC  Laboratoire de Physique Nucléaire et de Hautes Energies

  • Bertrand Laforge; Physique des particules élémentaires, Bioinformatique, Physique théorique, étude de propriétés émergentes dans les systèmes complexes-Modélisation et simulation, Simulation Multi-échelle, systèmes complexes, Stochasticité dans les processus biologiques

Institut Télécom; Télécom Bretagne, CGE, UMR 6285

  • Dominique Pastor;Traitement statistique  du signal; Transformations parcimonieuses; traitement des signaux physiologiques (interactions cardio-respiratoires)-Statistiques mathématiques (décision, estimation); Transformées (Fourier; ondelettes); probabilités; processus aléatoires

UMR IDEES CNRS-6266 Normandie Université Le Havre / E Laboratory on Human Trace Complex System UNESCO/ https://www.univ-lehavre.fr/spip.php?article254

Université de Rouen

  • Janine Guespin,  Professeur Émérite, retraitée: Dialectique; Comprendre la pensée du complexe qui émerge des pratiques scientifiques d’étude de systèmes complexes comme le système immunitaire Livre révolution du complexe
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